premiers éléments de réponse :

Que penser des 100% de recharge affichés, ayant remis les 56,4A debitées , mais chargeant encore de 5,3A à 1A en 9h, avec 0Ah et 100% tout ce temps...? BMV mal reglé ? un coup vicieux de peukert ?. pourtant j’ai suivi le manuel pas à pas, mais un croche pied n’est pas à exclure...
Tout ça un peu foutrac j’en conviens, mais c’est pour expliciter mes dernieres questions existentielles...

Welcome to the club

Au matin, aprés avoir coupe le chargeur la veille, je n’avais deja plus que 12,5 V ..

Ces 12 heures de repos après une charge font que la tension mesuré est un bon indicateur de charge de ta batterie.
12,5V, d’après les tables et la littérature, c’est une batterie OLA chargée à 70- 80% (avec 12,7 pour 100%), donc tu avais déchargé 35 à 55 Ah (20-30% de 180 Ah). Tu dis que tu avais fait une charge complète ... pas si complète que ça puisqu’il manque 35 à 55 Ah, ta batterie n’était rechargée qu’à 80 70%. Pas très complet tout ça

Origine de ce manque : en gros la phase de boost ne charge pas suffisamment puis la phase de bulk ne complète pas suffisamment.

Toujours retenir qu’un Ah fournit à une batterie sert pour 95% à charger la batterie (on le retrouve à la décharge) et pour 5% à électrolyser (produire hydrogène et oxygène, perdu en pure perte). Avec une batterie plus vieille ce sera 90% et 10% voir 85% et 15% (au delà c’est la benne).
Peuker c’est autre chose, lire l’article de Negofol sur ce site. Ici on peut garder les réglages par défaut

Les réglages de ton chargeur portent sur :

• la tension de charge (par ex 14,4 V)
• La tension de float (par ex 13,3V)
• sa « puissance » (par ex 20A, car 20 suffit pour ton parc de 180 Ah, et est moins cher qu’un 30 ou nu 40))
• ta batterie fait 180 Ah

rappel  :

• phase de boost dit aussi à courant constant : courant max possible du chargeur (par ex 20 A) jusqu’à atteindre la tension dite ’de charge’ (par ex 14,4V) et ce pendant au mieux 4h (durée de précaution qui dépend du constructeur du chargeur)
• phase de bulk, dite aussi à tension constante : le chargeur délivre ce qu’il faut d’Ah pour que la tension soit maintenu à la tension de charge (par ex 14,4V), l’intensité décroit jusqu’à ce qu’elle tombe en dessous d’un certain seuil (faible, dépend du constructeur, généralement 2 ou 3 A), le chargeur passe alors en phase de float, et charge sous (par ex.) 13,3V et 1 2 A (ça pourrait être 0,2 A) pendant un temps infini
• phase de float (voir ci-dessus) : cette phase de maintient sert uniquement à maintenir la batterie , compenser l’auto décharge. On ne la comptabilise pas dans la chage (ton « 5,3A à 1A en 9h » n’est pas pertinent)
• une phase de boost est censée remonter la batterie à 80% de charge, et la phase de bulk doit la remonter à 100%. Ce dernier rappel contient sans doute la cause de tes problèmes (boost insuffisant ou bulk insuffisant)

cause possible
Lors de la recharge complète pendant la phase de boost, ton chargeur à apporté au mieux 80 Ah (20 x 4). Si ta batterie était à 30% de charge (70% manquant, c.a.d 125 Ah, elle ne contient plus que 55 Ah), A la fin du boost il manquera encore 45 Ah. Dit autrement, à la fin du boost ta batterie sera rechargée au mieux à 75% (elle contient 55 + 80 = 135 Ah, c.a.d qu’elle est rechargée à 75% de sa capacité là où on espérait 80%).
 d’abord, ton chargeur fournit 19A et non pas 20 (95% de 20)
 Si ta batterie est vieillotte (15% pour l’électrolyse et non 5%) ton chargeur de 20A fournira uniquement 17A, soit 68 AH
au bout de 4h
 Si ton seuil tension de charge est réglé trop bas, cette tension sera vue trop tôt lors du boost qui du coup rechargera encore moins (passage prématuré en bulk )
En conjuguant ces deux défauts on a vite faite de n’apporter que 40 à 68 Ah pendant le boost, et la batterie n’est rechargée qu’à 50 ou 68% (55+40 ou 55+68, soit 50% à 68%) bien loin des 80% attendu d’une phase de boost)

Astuce (heuristique) pour évaluer la charge apportée lors du bulk : considérer que le bulk démarre à 20A et se termine à 2A. On prend une moyenne de 9A ((20-2)/2) qu’on multiplie par la durée de ce bulk, durée comptée depuis la fin du boost jusqu’au début du float.
Sachant qu’un bulk doit apporter les 20% restant (ici 36 Ah, 20% de 180), il doit durer au moins 4 heures, sachant que 10 heures est plutôt la moyenne (ne pas hésiter à relancer le chargeur après certain repos pour relancer le bulk et remplir sans faux col).
Mais si après le boost il reste 50% à 32% à apporter (voir les défauts ci-dessus) alors il faudra que le bulk dure 10 à 6,5 heures
 et je compte 100% là ou il faut compter 95% voir 85%

juge de paix possible

1. décharger la batterie sous intensité C/10 (18A) jusqu’à tomber à une tension inutilisable (certain utilisent 11,5V, d’autres utilisent 10,5V, un poil dangereux)
2. recharger jusqu’à observer une ébullition légère et une tension de 14,4V. Répéter plusieurs fois le boost qui à chaque coup n’apporte qu’au mieux 80A là ou il en faut près de 170
3. décharger complètement (11,5 ou 10,5, selon) à nouveau, voir ce que le moniteur dit avoir vu (idéalement pas loin de 170A mais si c’est 120 ...
4. recharger à nouveau jusqu’à pleine charge (ébullition, voir ci-dessus), voir ce que le moniteur à vu pour en déduire le 95% ou 85%, ou pour juger de la mortitude de la batterie